软件著作权和专利都属于知识产权保护范畴之内，软件也是可以申请专利的，只是比较困难。它们相同点很少，不同点却很多。

软著与专利的相同点是：申请成功都能获得部分地方政府的资助，并且都可以作为申请国家高新技术企业的条件等。

不同点是：

1、法律依据不同。软件著作权保护是依据《著作权法》和《计算机软件保护条例》来实行的;专利保护是依据《专利法》来实行的。

2、保护原则不同。软件著作权是在软件创作完成后自动产生的，也是自愿进行软件著作权登记。专利则必须向专利局提出申请才能获得保护。

3、保护对象不同。软件著作权申请提交的资料是源代码及用户操作手册，所以软件著作权保护的是表现形式，不保护思想。如果竞争对手吃透了软件改变代码重新编写功能一样的软件，那么也算不侵权。专利则不同，在申请时描述的是软件的设计构思，一旦获权后，他人只要采用了软件专利的设计构思或方案，就可能构成侵权。

4、申请通过率不同。软件著作权登记通过率极高，专利申请要求技术性高，并且要满足新颖性，创造性，实用性等诸多要求，申请难度较高，通过率低。

5、申请提供资料不同。软件著作权需提供：申请人身份证明文件、申请表、源代码及说明手册;专利需提供：申请人身份证明文件、委托说明书、技术交底书(外观专利则提供图片或照片)。

6、申请周期不同。软件著作权申请周期短，可做加急，最快能1天下证;专利申请周期长，尤其是发明专利，往往需要1-2年才能授权下证。

7、保护期限不同。软件著作权保护期为自然人终生及其死亡后50年，跟著作保护期限差不多。实用新型和外观设计保护期限从申请日起算10 年，发明专利则是20年。

8、申请和维护费用不同。软件著作权只有前期申请费用，没有后续的维护费用;专利除了要交前期的申请费用之外，每年都需要缴纳年费，过期不缴纳即视为放弃专利权。专利年费交几年才能交完

软件可以申请为专利，也可以申请为软著，专利保护价值更高，但专利申请费用也高。软著相对来说没有专利的保护好。